Pour visualiser les molécules présentées il faut utiliser
le "plugin" MDL Chime distribué gratuitement.
On peut télécharger ce plugin sur le site Symyx (anciennement
MDL) mais il faut s'inscrire au préalable...
Des infos supplémentaires sur wikipedia : http://en.wikipedia.org/wiki/MDL_Chime
Plusieurs version du plugin sont disponibles sans inscription sur le site de l'INRP (institut National de Recherche Pédagogique)
version la plus récente : version2.6SP7 (nov 2007)
d'autres versions plus anciennes sont disponibles (pour navigateur Internet anciens) : version2.6SP4 (oct 2002) version2.6SP5 (dec 2003) version2.6SP6 (mars 2004)
Installation pour Internet Explorer : Aprés téléchargement il faut installer le "plugin" en lancant le fichier téléchargé. Cela installe le plugin pour Internet Explorer
Pour utilisation avec Firefox il faut :
- Installer normalement le pluging pour Internet Explorer ;
- Copier les fichiers "chime" du dossier "plugins" de IE
(Program files/Internet Explorer/Plugins) dans le dossier "plugins"
de Firefox (Program files/Mozilla Firefox/Plugins)
Problèmes connus sous IE5 :
Si une molécule n'apparaît pas dans les fichier html: il suffit la plupart du temps de cliquer dans son
emplacement sur fond noir et elle devient visible.
Problèmes connus sous IE7 :
Autoriser le contenu bloqué (bandeau jaune en haut de l'écran)
.
Si les molécules ne s'affichent pas après redémarrage du système il faut essayer de diminuer le niveau de sécurité pour autoriser l'exécution des scripts permettant l'affichage et la manipulation des molécules.
- Le cliquer-glisser permet de faire tourner la molécule ;
- Les touches Maj + souris permettent un Zoom ;
- Les touches Ctrl + bouton droit permettent de déplacer la sélection
;
- Un clic du bouton droit sur la molécule ouvre un menu contextuel qui
permet de faire tourner la molécule, de choisir la représentation
(modèle compact, éclaté, fil de fer...).
Pour construire des molécules qui peuvent ensuite être visualisées
avec le plugin dans un navigateur Internet, on peut, par exemple utiliser Chemstekch
que l'on peut télécharger sur le site de acdlabs.
Il faut ensuite exporter ces molécules dans un format convenable : ".mol".
On peut ensuite utiliser "Molda" pour les convertir en ".pdb" (seul format accepté par certains navigateurs).